Αυτοματοποίηση της ανάλυσης μεσοζωοπλαγκτικών οργανισμών της ανατολικής Μεσογείου με τη χρήση του λογισμικού ZooImage

Στην παρούσα εργασία δοκιμάσθηκε το ελεύθερο λογισμικό ZooImage για την αυτόματη ταξινόμηση δειγμάτων μεσοζωοπλαγκτού των ελληνικών θαλασσών. Για το σκοπό αυτό μελετήθηκαν δείγματα από το Αιγαίο και το Ιόνιο και δείγματα παράκτιων υδάτων συμπεριλαμβανομένων λιμνοθαλάσσιων οικοσυστημάτων Το λογισμικό τροφοδοτήθηκε με εικόνες-πρότυπα για 27 ομάδες οργανισμών, και αξιολογήθηκε η συστηματική ταξινομική του ικανότητα σε σχέση με συμβατικές μεθόδους αναγνώρισης. Το ZooImage παρουσίασε αρκετά υψηλά ποσοστά αναγνώρισης. Ωστόσο το λογισμικό φαίνεται να είναι πιο αξιόπιστο για ανώτερα τάξα, π.χ. για τα Κωπήποδα παρά για το γένος Oithona. Ο χρόνος που εξοικονομείται για την αναγνώριση του μεσοζωοπλαγκτού είναι 6-12 φορές λιγότερος, σε σχέση με το χρόνο που απαιτείται με τη συμβατική μέθοδο αναγνώρισης, χωρίς ωστόσο να υποτιμάται ο ανθρώπινος παράγοντας και η παραδοσιακή μέθοδος ανάλυσης και ταξινόμησης.

In this study the open source ZooImage software for automatic classification of zooplankton samples of the Greek seas was tested. For this purpose, samples from the Aegean and Ionian Sea, as well as from coastal waters and lagoon ecosystems were used. The software was supplied with image-models for 27 groups of organisms and its systematic taxonomic ability was evaluated in relation to the conventional identification methods. ZooImage has fairly high recognition rates. However, the software seems to be more reliable with broad taxonomic groups, e.g. for Copepods, rather than Oithona spp. The time saved for identification of mesozooplankton is 6-12 times less than the time needed with the conventional way, without underestimating the human factor and the traditional method of analysis and classification.